انبثقت اللجنة التحضيرية للاتحاد النسائي البحريني عن الاجتماع العام الذي نظمته كل من جمعية نهضة فتاة البحرين وجمعية أوال النسائية في ابريل 2001، حيث ضمت في عضويتها (6) جمعيات نسائية و(14) لجنة نسائية بالجمعيات المهنية والجمعيات المختلطة واتحاد النقابات العمالية و(4) عضوات منتخبات يمثلن الأفراد.
وقد انتهت اللجنة من وضع النظام الأساسي للاتحاد في نوفمبر 2001 وتم رَفعه إلى وزارة العمل والشؤون الاجتماعية طلباً للترخيص.
دخل إشهار الاتحاد النسائي البحريني في إشكاليات عديدة لامتناع الجهة الرسمية عن إعطاء الترخيص للاتحاد النسائي البحريني طوال فترة امتدت من نوفمبر 2001 إلى يوليو 2004 ، َرفعت بعدها الجمعيات النسائية قضية على وزارة العمل في 24/7/2004، وصدر الحكم القضائي بإشهار الاتحاد النسائي البحريني في 28/2/2006 وفقا للنظام المرفوع من اللجنة التحضيرية، وأعقب ذلك عقد المؤتمر التأسيسي للاتحاد في 16/9/2006 ، وانتخاب أول مجلس إدارة للاتحاد , وهو منظمة أهلية ذات طبيعة ديمقراطية ويعتبر اتحاداً نوعياً للجمعيات النسائية البحرينية المنضوية تحت لوائه، وقد تم تسجيل الإتحاد بوزارة التنمية الاجتماعية تحت قيد رقم (1/أ ت / س ص).